我懂你这种慌，我自己 2024 年第一次搞 Shopify 本地开发，也是被那堆文件结构整破防了。
但你要真想本地开发，建议别用 CLI 初始化那个主题，它会自动拉 Dawn 主题的完整副本，里面文件多到你翻半天。不如自己从零手动搭个轻量 React 项目，然后用 Storefront API 拉数据。虽然绕了点路，但你只写自己需要的组件，不碰那些 Liquid 区块，反而省心。
另外说个反常识的：本地开发改完代码后，部署到 Shopify 并不比直接在线改快多少。它那个 Theme Sync 功能同步一次要十几秒，你改个 bug 来回测几次就一上午没了。我那时改个购买按钮的文案，本地改+部署+测试，花了两个小时，结果最后发现不如在后台直接用代码编辑器改 Liquid。
你既然有前端基础，不如先试试后台的代码编辑器。真遇到改不动的地方再切本地。别一开始就往复杂搞，心态容易崩。

楼主别听楼上说得那么玄乎，我两个店都是本地撸的，没那么复杂。
你基础前端没问题的话，装个 Shopify CLI 跟着文档走就行。初始化命令 shopify app init，选 Remix app 那个模板，剩下就是写 React 组件的事。只是要注意节点版本，我去年装的时候用 Node 16 报了一堆兼容错误，切到 18 才跑起来。
但说句实话，如果只是改改 UI，你直接改 Live Theme 的 Liquid 文件也比搞 CLI 快。我第一个月吭哧吭哧搞了套本地开发，结果发现改个按钮颜色还不如在那傻拖几下。
不过有一说一，2026 年 Shopify 的 CLI 体验比 2024 好太多了，至少不用手动配 Webpack 了。楼主自己权衡，反正最差也就是多花两天环境调试，不会亏多少。

姐妹们我说个踩雷经历。去年我第一次用 CLI 跑 Shopify 本地开发，结果因为没装好 Node 依赖包，项目起不来，折腾了三天才搞明白是少了某个 build tool。最后项目是跑起来了，但我那周就因为这事错过了新品上架的排期，生生晚了一周。
后来我反思了下，如果你只是改改 Theme 的样式或加个自定义区块，真没必要上 CLI。Shopify 后台那个编辑器 2025 年更新后已经能直接在线改 CSS 和 Liquid 了，省很多事。反而是那些想从零搭 App 的才需要本地环境。
所以我的建议是：先确认你到底要改什么。如果只是换图改颜色、加个倒计时啥的，后台直接搞定。如果非要搞 App 级别，那你别犹豫直接 CLI。别因为觉得"本地开发才是专业的"就硬上，时间也是成本。

这事我也想问，我 2023 年开始碰 Shopify 时也是一脸懵，都在说用 CLI 初始化，结果自己跑一遍才发现它内部逻辑跟传统前端开发完全两码事。
你说准备本地开发，我建议你直接去看 Shopify CLI 3.0 那一套，2025 年底已经更新到用 Node.js 18 了。核心是装完 CLI 后输入 shopify theme init，它会给你生成一个基于 Dawn 主题的本地项目，然后你本地改完代码推上商店就行。
但有个坑，你改了主题文件后，如果后台有人用拖拽编辑器动了某个区块，本地推送上去会冲突。我去年就因为这个把首页轮播图搞崩了，两个客人下单时页面直接报 Redux 的错误，最后只能回滚。所以如果你自己开发，最好在开发分支上搞，线上别直接推送。
还有一点，Liquid 模板文件看起来像 HTML，但里面那些 {% for %}、{% include %} 逻辑，第一次调会卡很久。我建议你先把 https://shopify.dev/docs/themes/liquid/reference 这个页面过一遍，不然会浪费很多时间在语法查错上。
如果你只是想改点颜色字体，那不如直接用后台编辑器，真的。本地开发是给要深度定制 App 或改整个页面结构的人准备的，不是轻量修改的方案。